Głównym elementem sanktuarium jest kościół pod wezwaniem Matki Bożej Fatimskiej. Został on poświęcony przez papieża Jana Pawła II, 7 czerwca 1997 r., w czasie jednej z jego pielgrzymek do Polski. W kościelnej wieży znajduje się dzwon, a w fundamentach różaniec i zdjęcie papieża Polaka, które ofiarowane zostały przez Karola Wojtyłę.
Tuż obok kościoła, podziwiać możemy kaplicę, wybudowaną w latach 50. ubiegłego stulecia. Umieszczona w niej została figura Matki Boskiej Fatimskiej, którą przekazał tutaj prymas tysiąclecia, kardynał Stefan Wyszyński.
Na terenie sanktuarium znajduje się także ołtarz, przy którym Jan Paweł II odprawił mszę świętą w Zakopanem w czerwcu 1997 roku. Ponadto, tuż obok, podziwiać możemy pomnik papieża Polaka. Poza tym, znajduje się tu także kaplica upamiętniająca śmierć Karola Wojtyły.
Pierwszym kustoszem i opiekunem sanktuarium był ks. Mirosław Drozdek. Obecnie funkcję tą pełni ks. Marian Mucha.